токен прописать - ну владельца репозитория просить наверн. или форкаться и пулреквестами правки отдавать.
а поверх ссх работать - склонировать репу с адресом вида
git@github.com:user/repo.git
и работать уже в склонированном. адрес для клонирования можно прям с гитхаба найти, прячется под кнопкой Clone, обычно два варианта есть, https и ssh